Au sein des écoles doctorales près le F.R.S.-FNRS (Graduate Colleges) peuvent être créées une ou plusieurs écoles doctorales thématiques (Graduate Schools).
Une école doctorale thématique (Graduate School) peut relever de plusieurs écoles doctorales près le F.R.S.-FNRS (Graduate Colleges).
Chaque école doctorale thématique (Graduate School) est placée sous la responsabilité d'un comité scientifique.

Biologie Cellulaire et Moléculaire, Biochimie

Biodiversity, Ecology, Evolution

Chimie moléculaire, supramoléculaire et fonctionnelle

Phénomènes non-linéaires, systèmes complexes et mécanique statistique

Géographie

Sciences et ingénierie des Matériaux, Interfaces et nanostructures

Mathématiques

Méthodes Expérimentales et Théoriques : Atomes, Molécules et supRamolécules, PHOtons, Spectres et Electrons

Ecole doctorale en Physique et en Astrophysique

Plant science

Structure et Fonction des Macromolécules Biologiques, Bioinformatique et Modélisation

Statistiques et sciences actuarielles

Sciences de l'Univers, de l'Espace, de la Terre et du Climat